1、首先從命名上就可以看出來，獨立與非獨立機組的命名是從機組的動力輸出來講的，獨立機組擁有單獨的動力源既機組本身所獨立的柴油發(fā)動機作為其動力源；而非獨立式機組的動力輸出是依靠汽車底盤的發(fā)動機來帶動的

2、從動力輸出就可以看出他們的差異性，當汽車發(fā)動機停止運轉的時候非獨立式制冷機組既失去動力支持，制冷系統(tǒng)停止工作，如果在汽車熄火的時候頻繁的打開車廂門將使汽車箱體內冷氣大量流失造成車廂內溫度升高，或者在汽車出現故障時（發(fā)動機故障）制冷機也將停止制冷，車廂內貨物的品質也得不到保證。

兩者的優(yōu)缺點
非獨立式制冷機組系統(tǒng)結構簡單易于維護和保養(yǎng)
獨立式制冷機組因為多了發(fā)動機系統(tǒng)保養(yǎng)和維修稍微復雜

該如何選擇？
從運輸的用途來講，如果是用作市內或者區(qū)縣間的短距離配送，建議使用非獨立機組（采購成本低，市內哪怕是出現故障也不擔心沒地方修）
反之是進行長途運輸的則建議使用獨立式制冷機，因為在長途運輸過程中哪怕汽車發(fā)動機停止工作，制冷機仍然可以正常制冷，滿足所運輸物品的安全

另外從所配車型來講
7米及7米以下車廂建議使用非獨立式機組
7米以上車廂用獨立式比較好

從成本上講非獨立式制冷機組與獨立式制冷機組價位相差在幾萬以上，如果預算上比較充裕，而且又對車廂內溫度要求比較低（所需溫度至少要零下10度以下）的話建議還是用獨立式比較好。